In den Jahren 1994 bis 2010 wurden die Gebäude des Matthes-Enderlein-Gymnasiums Zwönitz in mehreren Bauabschnitten umfangreich umgebaut, erweitert und modernisiert.

Im Zuge der Baumaßnahmen wurden in den Häusern 1 und 2 des Matthes-Enderlein-Gymnasiums die gesamten elektrotechnischen Anlagen erneuert. Zusätzlich wurden eine Sicherheitsbeleuchtung sowie eine Brandmeldeanlage der Kategorie 2 errichtet. Für die Beleuchtungs-, Jalousie- und Heizungssteuerung wurde ein KNX-Bus realisiert. Das Gymnasium erhielt ein strukturiertes Datennetz für die EDV- und Telefonanlage.

Die Fachkabinette sowie der Mehrzweckraum wurden umgestaltet und modernisiert. Eine Speisenausgabe wurde errichtet.

Das Haus 2 erhielt eine Photovoltaikanlage.